Обращения читателей и персональные случаи ДНК-генеалогии Part 84 Анатолий А. Клёсов

Обращения читателей и персональные случаи ДНК-генеалогии Part 84 Анатолий А. Клёсов ПИСЬМО 288

фото

Я хотел бы стать специалистом по интерпретации данных ДНК-генеалогии. Надо же рисковать и пробовать освоить это дело. Двумя имеющимися специалистами в мире (Вы и Игорь Львович) мы так в будущем не управимся. Надо потихоньку готовиться расширять круг возможностей вместе с развитием будущей сети структур, которые будут работать на Академию ДНК-генеалогии и её лабораторию. В общем, решил рискнуть и попробовать это сделать по классической Вашей схеме, рассмотрев гаплотип моего знакомого и определив для него гаплогруппу R1b-Z2103. Если будет время, прошу Вас ознакомиться и дать своё заключение с указанием на возможные ошибки. Можно даже опубликовать в Вестнике с разбором, если оно того стоит. В любом случае рассчитываю на Вашу критику. MОЙ ОТВЕТ: Ваше желание стать специалистом по интерпретациям понятно. Более того, Вы правильно назвали субклад, это R1b-Z2103. Правда, назвать неправильно было бы трудно, в России почти у всех носителей R1b субклад Z2103, если первая цифра 12. Тем не менее, это Ваш успех. Если было бы 13, задача резко усложнилась, поскольку это мог быть и Z2103 с такой мутацией, и десятки европейских вариантов. Теперь что касается методологии определения - определение производится построением дерева гаплотипов с добавлением анализируемого гаплотипа, в данном случае 18-маркерного дерева. Для 23-маркерных гаплотипов должно быть построено 23-маркерное дерево, для других гаплотипов тестируемого - 25-, 37, 67, или 111-маркерное дерево, и все они должны быть заранее обкатаны. Это все берется из соответствующих баз данных, и так для всех гаплотипов. Подготовка к этому производится в ходе фактической работы в течение месяцев работы, у меня это заняло уже два года, и приходится обновлять данные время от времени, потому что базы данных расширяются. Вот как выглядит ветвь дерева с гаплотипом, который Вы анализировали:см вложение. Это гаплотип под индексом X1701. Рядом, кстати, сидит гаплотип Х0105, они почти братья. У последнего тоже R1b-Z2103. Что важно, и зачем нужно дерево - это посмотреть, с гаплотипами каких субкладов и из каких стран наиболее близко сидит представленный гаплотип. В этом случае - все гаплотипы (кроме 578) здесь относятся к Z2103, поэтому ясно, что у ПТТ тоже Z2103. Гаплотип 578 относится к R1b-L21, но у него случайно оказалось DYS393=12, что характерно для L23 и Z2103, и его занесло на эту ветвь. Остальные гаплотипы - из России, Польши, Германии, Норвегии, Чехии, Испании, Армении. Поэтому существенную часть Интерпретации составляет анализ дерева и соответствующей ветви. Всего хорошего, ПРОДОЛЖЕНИЕ ПЕРЕПИСКИ: Уважаемый Анатолий Алексеевич, благодарю за оказанное внимание. У меня не столько желание стать специалистом в данном направлении, сколько желание понять матчасть интерпретации, чтобы можно было компетентно отвечать на эти вопросы, и при необходимость дать правильный совет человеку при обращении. И тут я вижу, что не доработал. Ветвь Z2103 вычислил изучив Ваши работы по М269, а вот совет всё же дал не верный: "Для экономии времени и расходов на выявление своей подветви можно заказать анализ на снип к Z2103, а при положительном его результате на гаплотип L-23. Либо сразу заказать тестирование на L23, что в свою очередь повлечёт либо сокращение, либо увеличение расходов. " Если Z2103 + совет надо было давать на более углублённые его ветви. А это не L23, а Z2103 > L277 (L584, STS682), т.е. нисходящие снипы от Z2103. Тут я вижу свою ошибку, если всё понял правильно. Если так, то можно безошибочно определить, какой снип нужно заказать для проверки. Для этого надо учится строить ветви дерева. МОЙ ОТВЕТ: Да, это верно, Z2103 находится ниже L23, поэтому совет - если нужно проверить, надо сначала проверить Z2103, а ниже него там еще десятки снипов. Я не знаю, зачем в данном случае тратить деньги и искать нижестоящие к Z2103, и какую загадку это решит. Насколько понимаю, никакой конкретной. Например, носитель гаплотипа Х0105 был уже счастлив, узнав, что у него Z2103, и что предки у него в знаменитой ямной культуре. А что дадут более глубокие снипы? Если только отвечать на какой-то важный исторический (или семейный) вопрос, на который ответа пока нет. Наша лаборатория определяет снипы, но, как правило, самые поверхностные. Например, R1a-M198. Может определять любые, дело только в закупке праймеров, но таких заказчиков пока нет, чтобы оправдать закупки. Можем пойти по более современному пути, и делать сразу тысячи снипов в одном тесте, но для этого нужно 250 тысяч долларов на первые тысячу человек. Тогда будем делать только гаплотип, что примерно 80 долларов, и массу снипов за 250 долларов с человека. Как видите, это уже 330 долларов за тест. Если будут дотации в виде дополнительного финансирования, то появится смысл. FTDNA делает такой общий снип-тест (BigY) за 599 долларов, плюс цена определения гаплотипа.